Средняя школа №3 была основана в 1962 году.
За 44 года из стен школы вышли 2224 выпускника. 10 учеников окончили школу с золотыми медалями, 41ученик – с серебряными.
В 1991 году в школе организована первая в городе психологическая служба.
С 1993 по 2015 годы учреждение оказывала дополнительные образовательные услуги, в том числе платные.
В 1999 году программа «Здоровье» стала одной из лучших в областном конкурсе подобных программ.
В 2000 году – начали заниматься допрофессиональной и профессиональной подготовкой школьников: парикмахер, оператор ЭВМ, с 2005 г. — водитель категории «В», «ВС».
В 2001 году – создан первый в области местный благотворительный фонд развития МОУ «Средней школы №3» и Попечительский совет.
В 2005 году МОУ «Средняя школа №3» было реорганизовано путем присоединения к нему учреждения дополнительного образования «Станция юных техников», открыло на базе школы учебно-консультационный пункт и принятие 60 учащихся из расформированной школы №6 (учащихся с девиантным поведением).
Изменение структуры учреждения заставило задуматься над образовательной программой школы, о работе в новых условиях. С 2000 по 2005 г.г. педагогический коллектив школы работал по программе «Становление адаптивной школы». МОУ «Средняя школа №3» — адаптивная школа, школа со смешанным контингентом учащихся, где учатся одаренные и обычные дети, а также дети, нуждающиеся в коррекционно-развивающем обучении.